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SNP Information

dbSNP ID  rs3177318
JSNP ID  -
Chromosome  6
Chromosome Position  26202948
Strand  +
Allele  C/T
Validation Class  SNP: single nucleotide polymorphism
SNP Effect  POLYPHEN  SIFT

Gene Information

Type mRNA Accession Gene Strand mRNA_Pos Codon_Pos Protein_Pos Allele Codons AminoAcid
 3UTR  NM_000410  HFE  +  1722  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139003  HFE  +  1404  -  -  C/T    -
 Intron  NM_139002  HFE  +  -  -  -  C/T    -
 Intron  NM_139005  HFE  +  -  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139006  HFE  +  1680  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139007  HFE  +  1458  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139008  HFE  +  1416  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139009  HFE  +  1653  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139004  HFE  +  1446  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139010  HFE  +  1182  -  -  C/T    -
 3UTR  NM_139011  HFE  +  906  -  -  C/T    -

Disease Information

Disease Hit  0
Disease Name  -
Others  -

Disease Information

dbSNP JSNP ALFRED
 
TC
01
  
  -   -

Flanking Sequence

dbSNP
>gnl|dbSNP|rs3177318 rs=3177318|pos=51|len=101|taxid=9606|mol=cDNA|class=1|alleles=C/T|build=105
ACTTTTCCTTTGAATCCTCTCTCTGTGTTACCCAGTAACTCATCTGTCAC
Y
AAGCCTTGGGGATTCTTCCATCTGATTGTGATGTGAGTTGCACAGCTATG 
JSNP
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ACTTTTCCTTTGAATCCTCTCTCTGTGTTACCCAGTAACTCATCTGTCAC
Y
AAGCCTTGGGGATTCTTCCATCTGATTGTGATGTGAGTTGCACAGCTATG