Genome Browser


<font color='red'>SUN JRE 1.4 or higher is required.</font>

SNP Information

dbSNP ID  rs1800758
JSNP ID  IMS-JST035224
Chromosome  6
Chromosome Position  26201215
Strand  +
Allele  A/G
Validation Class  SNP: single nucleotide polymorphism
SNP Effect  POLYPHEN  SIFT

Gene Information

Type mRNA Accession Gene Strand mRNA_Pos Codon_Pos Protein_Pos Allele Codons AminoAcid
 Intron  NM_000410  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139003  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139002  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139005  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139006  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139007  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139008  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139009  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139004  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139010  HFE  +  -  -  -  A/G    -
 Intron  NM_139011  HFE  +  -  -  -  A/G    -

Disease Information

Disease Hit  0
Disease Name  -
Others  -

Disease Information

dbSNP JSNP ALFRED
 
GA
0.9860.013
  
 
GA
0.9090.091
  
  -

Flanking Sequence

dbSNP
>gnl|dbSNP|rs1800758 rs=1800758|pos=61|len=121|taxid=9606|mol=genomic|class=1|alleles=A/G|build=100
ATTGTGATCTGGGGTATGTGACTGATGAGAGCCAGGAGCTGAGAAAATCT
ATTGGGGGTT
R
AGAGGAGTGCCTGAGGAGGTAATTATGGCAGTGAGATGAGGATCTGCTCT
TTGTTAGGGG 
JSNP
>gnl|dbSNP|rs1800758 rs=1800758|pos=61|len=121|taxid=9606|mol=genomic|class=1|alleles=A/G|build=100
ATTGTGATCTGGGGTATGTGACTGATGAGAGCCAGGAGCTGAGAAAATCT
ATTGGGGGTT
R
AGAGGAGTGCCTGAGGAGGTAATTATGGCAGTGAGATGAGGATCTGCTCT
TTGTTAGGGG